Une fondation individualisée (abritée) est créée lorsqu’une ou des personnes accordent, de manière définitive, à la Fondation du Protestantisme des biens, des droits ou des ressources en vue de la réalisation d’une oeuvre d’intérêt général et à but non lucratif. On parle alors de dotation initiale.

Chaque fondation individualisée dispose d’un règlement précisant notamment son objet et d’un comité de suivi chargé de son animation. Elle bénéficie, par capillarité, des avantages patrimoniaux et fiscaux d’une fondation reconnue d’utilité publique.

Une fondation individualisée ne dispose pas de la personnalité juridique, elle exerce ainsi sa mission d’intérêt général sous l’égide de la fondation abritante, la Fondation du Protestantisme.